The name of this superfamily has been modified since the most recent official CATH+ release (v4_4_0). At the point of the last release, this superfamily was named:
"Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H
".
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ID | Function Family (FunFam) Name | Total Sequences | Enzyme? | Structure? | Structural Representative | PDB Sites? | Alignment Diversity (0-100) |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1060 | 3D |
6n4oA04 | - | 71.4 | ||
2 | 852 | 3D |
1hjrD00 | - | 94.1 | ||
3 | 715 | 3D |
2igiB00 | - | 97.1 | ||
4 | 586 | 3D |
3iayA03 | - | 91.8 | ||
5 | 512 | 3D |
4gmjF00 | - | 84.7 | ||
6 | 459 | - | - | 88.2 | |||
17 | 452 | 3D |
5hrsA00 | - | 76.4 | ||
8 | 440 | 3D |
3aa5X00 | - | 84.5 | ||
9 | 407 | 3D |
4kb1B00 | - | 75.3 | ||
25 | 397 | 3D |
5j2qA05 | - | 78.5 | ||
7 | 376 | 3D |
1wljA00 | - | 95.3 | ||
10 | 323 | - | - | 90.6 | |||
12 | 291 | 3D |
2xy8A00 | - | 94.7 | ||
11 | 288 | - | - | 82.8 | |||
13 | 272 | - | - | 78.7 | |||
14 | 237 | - | - | 90.8 | |||
16 | 224 | 3D |
3pufP01 | - | 94.0 | ||
15 | 218 | - | - | 63.1 | |||
20 | 198 | 3D |
4fzzB00 | - | 29.7 | ||
18 | 198 | 3D |
4qclA03 | - | 86.8 | ||
19 | 194 | - | - | 88.1 | |||
21 | 191 | - | - | 82.1 | |||
22 | 190 | 3D |
3sahB01 | - | 87.3 | ||
26 | 180 | 3D |
2kzzA01 | - | 95.9 | ||
23 | 174 | - | - | 46.5 | |||
24 | 171 | - | - | 92.6 | |||
27 | 160 | - | - | 82.0 | |||
28 | 149 | - | - | 90.5 | |||
46 | 144 | 3D |
5ywvB01 | - | 91.4 | ||
29 | 142 | 3D |
2xriA01 | - | 47.4 | ||
30 | 141 | - | - | 75.1 | |||
33 | 138 | 3D |
4js5B01 | - | 90.0 | ||
31 | 134 | - | - | 96.3 | |||
32 | 132 | - | - | 96.7 | |||
34 | 124 | 3D |
1zbuD01 | - | 90.9 | ||
35 |
A
|
122 | 3D |
2a1sD01 | - | 65.1 | |
36 | 117 | 3D |
4fydB03 | - | 85.7 | ||
263 | 109 | 3D |
5uoqB00 | - | 28.9 | ||
37 | 107 | - | - | 74.4 | |||
38 | 107 | - | - | 72.9 | |||
39 | 105 | - | - | 85.4 | |||
40 | 102 | - | - | 82.8 | |||
41 | 102 | - | - | 92.8 | |||
49 | 100 | 3D |
2qkkW00 | - | 77.7 | ||
42 |
A
|
100 | - | - | 47.8 | ||
52 | 97 | 3D |
3maqA03 | - | 77.3 | ||
43 | 96 | - | - | 89.2 | |||
45 | 96 | 3D |
2p1jB01 | - | 98.2 | ||
44 | 94 | - | - | 7.7 | |||
47 | 93 | 3D |
3vn5A02 | - | 91.4 | ||
48 | 90 | 3D |
3g10A00 | - | 91.0 | ||
53 | 90 | 3D |
2e6mA00 | - | 78.7 | ||
50 | 86 | - | - | 31.1 | |||
51 | 86 | - | - | 77.6 | |||
54 | 79 | - | - | 96.5 | |||
55 | 78 | - | - | 71.6 | |||
56 | 73 | - | - | 73.5 | |||
57 | 69 | - | - | 56.6 | |||
58 | 68 | - | - | 87.6 | |||
59 | 66 | 3D |
4nlcA01 | - | 88.5 | ||
60 | 64 | 3D |
1yt3A01 | - | 82.1 | ||
61 | 61 | - | - | 89.4 | |||
62 | 59 | - | - | 72.7 | |||
63 | 55 | - | - | 93.8 | |||
64 | 54 | - | - | 71.8 | |||
65 | 54 | - | - | 76.4 | |||
66 | 53 | - | - | 74.9 | |||
67 | 51 | - | - | 94.6 | |||
68 | 49 | - | - | 63.2 | |||
72 | 47 | 3D |
1nozB02 | - | 27.7 | ||
69 | 46 | - | - | 70.6 | |||
70 | 45 | - | - | 73.9 | |||
71 | 43 | - | - | 47.7 | |||
73 | 43 | - | - | 17.2 | |||
74 | 42 | - | - | 87.7 | |||
75 | 41 | - | - | 4.7 | |||
76 | 40 | - | - | 95.0 | |||
77 | 39 | - | - | 87.9 | |||
78 | 38 | - | - | 82.2 | |||
79 | 38 | - | - | 73.6 | |||
80 | 37 | - | - | 80.6 | |||
82 | 36 | - | - | 78.8 | |||
81 | 36 | - | - | 83.5 | |||
83 | 35 | - | - | 14.2 | |||
84 | 31 | - | - | 0.0 | |||
85 | 31 | - | - | 21.9 | |||
89 | 30 | 3D |
3h08B00 | - | 88.2 | ||
86 | 29 | - | - | 32.5 | |||
87 | 28 | - | - | 83.3 | |||
88 | 28 | - | - | 73.6 | |||
91 | 27 | - | - | 85.8 | |||
92 | 27 | - | - | 9.6 | |||
90 | 27 | - | - | 86.7 | |||
449 | 27 | 3D |
2pzsD01 | - | 3.9 | ||
93 | 26 | - | - | 23.8 | |||
161 | 26 | 3D |
5v5fC00 | - | 88.0 | ||
107 |
A
|
26 | 3D |
4b8cF00 | - | 77.5 | |
94 | 24 | - | - | 29.6 | |||
95 | 24 | - | - | 62.1 | |||
184 | 23 | 3D |
4fw2B01 | - | 16.6 | ||
102 | 23 | 3D |
5dmrA00 | - | 33.2 | ||
96 | 22 | - | - | 63.6 | |||
97 | 22 | - | - | 89.0 | |||
139 | 21 | 3D |
2dfhA01 | - | 92.7 | ||
99 | 21 | - | - | 14.3 | |||
100 | 21 | - | - | 84.2 | |||
101 | 21 | - | - | 77.8 | |||
98 | 21 | - | - | 49.3 | |||
157 | 20 | 3D |
5dk5B01 | - | 90.0 | ||
105 | 19 | - | - | 3.5 | |||
103 | 19 | - | - | 69.4 | |||
106 | 19 | - | - | 7.2 | |||
104 | 19 | - | - | 84.1 | |||
112 | 18 | - | - | 9.4 | |||
142 | 18 | 3D |
4hhtA00 | - | 77.7 | ||
111 | 18 | - | - | 22.4 | |||
110 | 18 | - | - | 4.8 | |||
163 | 18 | 3D |
5c0yB01 | - | 14.0 | ||
108 | 18 | - | - | 1.2 | |||
109 | 18 | - | - | 69.6 | |||
113 | 17 | - | - | 81.7 | |||
119 | 17 | - | - | 34.1 | |||
118 |
A
|
17 | - | - | 3.8 | ||
116 |
3'-5' exonuclease
|
17 | - | - | 4.5 | ||
117 | 17 | - | - | 0.7 | |||
120 |
A
|
17 | - | - | 83.2 | ||
115 | 17 | - | - | 89.6 | |||
114 | 17 | - | - | 75.1 | |||
124 | 16 | - | - | 4.8 | |||
134 | 16 | 3D |
1wnsA02 | - | 25.6 | ||
121 | 16 | - | - | 17.7 | |||
122 | 16 | - | - | 5.8 | |||
123 |
A
|
16 | - | - | 8.9 | ||
128 |
A
|
15 | - | - | 48.2 | ||
129 | 15 | - | - | 7.9 | |||
131 | 15 | - | - | 78.1 | |||
125 | 15 | - | - | 0.0 | |||
126 | 15 | - | - | 13.7 | |||
127 | 15 | - | - | 11.7 | |||
130 | 15 | - | - | 61.6 | |||
132 | 14 | - | - | 17.0 | |||
133 | 14 | - | - | 49.7 | |||
136 |
A
|
14 | - | - | 18.3 | ||
137 | 14 | - | - | 0.0 | |||
135 | 14 | - | - | 17.0 | |||
160 | 14 | 3D |
1kcfB00 | - | 87.4 | ||
138 | 14 | - | - | 78.0 | |||
140 | 14 | - | - | 95.3 | |||
149 | 13 | - | - | 83.8 | |||
183 | 13 | 3D |
4fcyB03 | - | 26.8 | ||
148 | 13 | - | - | 3.6 | |||
141 | 13 | - | - | 21.3 | |||
144 | 13 | - | - | 13.8 | |||
143 | 13 | - | - | 6.6 | |||
147 | 13 | - | - | 14.0 | |||
145 | 13 | - | - | 78.1 | |||
146 | 13 | - | - | 62.8 | |||
164 | 13 | 3D |
2ajqF01 | - | 13.9 | ||
151 | 13 | - | - | 79.5 | |||
150 | 13 | - | - | 80.3 | |||
158 | 12 | - | - | 47.8 | |||
156 | 12 | - | - | 84.6 | |||
153 | 12 | - | - | 0.0 | |||
155 | 12 | - | - | 2.8 | |||
154 | 12 | - | - | 92.1 | |||
152 | 12 | - | - | 1.9 | |||
159 | 12 | - | - | 83.6 | |||
165 | 11 | - | - | 42.1 | |||
166 | 11 | - | - | 82.7 | |||
167 | 11 | - | - | 82.8 | |||
162 | 11 | - | - | 28.4 | |||
170 | 10 | - | - | 1.4 | |||
168 | 10 | - | - | 32.2 | |||
178 | 10 | - | - | 8.2 | |||
179 | 10 | - | - | 65.3 | |||
177 | 10 | - | - | 42.2 | |||
171 | 10 | - | - | 0.0 | |||
176 | 10 | - | - | 17.7 | |||
175 | 10 | - | - | 86.8 | |||
174 | 10 | - | - | 31.3 | |||
173 | 10 | - | - | 62.2 | |||
169 | 10 | - | - | 76.9 | |||
172 | 10 | - | - | 41.0 | |||
181 | 9 | - | - | 84.5 | |||
186 | 9 | - | - | 85.4 | |||
185 | 9 | - | - | 9.6 | |||
180 | 9 | - | - | 38.9 | |||
187 | 9 | - | - | 66.2 | |||
182 | 9 | - | - | 2.6 | |||
191 | 8 | - | - | 11.8 | |||
192 | 8 | - | - | 7.4 | |||
193 | 8 | - | - | 37.6 | |||
196 |
A
|
8 | - | - | 41.1 | ||
194 | 8 | - | - | 36.9 | |||
195 | 8 | - | - | 69.1 | |||
188 | 8 | - | - | 0.7 | |||
189 | 8 | - | - | 43.4 | |||
208 | 8 | 3D |
1s5jA02 | - | 74.1 | ||
190 | 8 | - | - | 18.1 | |||
207 | 7 | - | - | 3.3 | |||
217 | 7 | - | - | 62.6 | |||
209 | 7 | - | - | 2.9 | |||
199 | 7 | - | - | 15.5 | |||
204 | 7 | - | - | 21.1 | |||
205 | 7 | - | - | 1.3 | |||
214 | 7 | - | - | 15.5 | |||
215 | 7 | - | - | 91.7 | |||
212 | 7 | - | - | 15.4 | |||
198 | 7 | - | - | 32.6 | |||
202 | 7 | - | - | 69.1 | |||
210 | 7 | - | - | 5.5 | |||
213 | 7 | - | - | 0.0 | |||
200 | 7 | - | - | 62.5 | |||
203 | 7 | - | - | 13.5 | |||
211 | 7 | - | - | 1.1 | |||
218 | 7 | - | - | 41.3 | |||
221 | 7 | - | - | 95.3 | |||
219 | 7 | - | - | 67.0 | |||
206 | 7 | - | - | 8.3 | |||
220 | 7 | - | - | 80.8 | |||
197 | 7 | - | - | 32.2 | |||
201 | 7 | - | - | 38.8 | |||
216 | 7 | - | - | 3.3 | |||
232 | 6 | - | - | 72.2 | |||
225 | 6 | - | - | 5.9 | |||
222 | 6 | - | - | 47.2 | |||
224 | 6 | - | - | 12.2 | |||
233 | 6 | - | - | 5.3 | |||
236 | 6 | - | - | 5.4 | |||
234 | 6 | - | - | 8.9 | |||
227 | 6 | - | - | 4.5 | |||
226 | 6 | - | - | 0.0 | |||
237 | 6 | - | - | 0.5 | |||
235 | 6 | - | - | 4.3 | |||
229 | 6 | - | - | 13.9 | |||
228 | 6 | - | - | 12.6 | |||
238 | 6 | - | - | 55.7 | |||
240 | 6 | - | - | 92.3 | |||
230 | 6 | - | - | 0.6 | |||
239 | 6 | - | - | 23.5 | |||
231 | 6 | - | - | 4.0 | |||
223 | 6 | - | - | 69.3 | |||
272 | 5 | - | - | 53.5 | |||
262 | 5 | - | - | 2.5 | |||
252 | 5 | - | - | 1.8 | |||
267 | 5 | - | - | 12.0 | |||
273 | 5 | - | - | 76.5 | |||
253 | 5 | - | - | 5.5 | |||
258 | 5 | - | - | 13.0 | |||
248 | 5 | - | - | 3.5 | |||
260 | 5 | - | - | 6.3 | |||
264 | 5 | - | - | 0.0 | |||
259 |
DNA directed
|
5 | - | - | 33.4 | ||
249 | 5 | - | - | 2.1 | |||
244 | 5 | - | - | 68.4 | |||
265 | 5 | - | - | 8.5 | |||
256 | 5 | - | - | 4.7 | |||
270 | 5 | - | - | 0.0 | |||
261 | 5 | - | - | 6.5 | |||
246 | 5 | - | - | 66.7 | |||
257 | 5 | - | - | 9.2 | |||
247 | 5 | - | - | 80.4 | |||
271 | 5 | - | - | 85.3 | |||
242 | 5 | - | - | 72.4 | |||
254 | 5 | - | - | 0.0 | |||
243 | 5 | - | - | 29.5 | |||
268 | 5 | - | - | 7.6 | |||
255 | 5 | - | - | 11.9 | |||
274 | 5 | - | - | 77.5 | |||
250 | 5 | - | - | 9.2 | |||
276 | 5 | - | - | 76.0 | |||
269 | 5 | - | - | 78.7 | |||
275 | 5 | - | - | 66.8 | |||
251 | 5 | - | - | 2.5 | |||
245 | 5 | - | - | 12.3 | |||
241 | 5 | - | - | 50.5 | |||
266 | 5 | - | - | 79.3 | |||
294 | 4 | - | - | 36.3 | |||
278 | 4 | - | - | 59.9 | |||
335 | 4 | 3D |
2lsnA00 | - | 14.4 | ||
305 | 4 | - | - | 12.5 | |||
281 | 4 | - | - | 21.4 | |||
279 | 4 | - | - | 80.8 | |||
293 | 4 | - | - | 19.6 | |||
310 | 4 | - | - | 63.1 | |||
280 | 4 | - | - | 28.1 | |||
288 | 4 | - | - | 2.5 | |||
297 | 4 | - | - | 68.7 | |||
283 | 4 | - | - | 7.7 | |||
295 | 4 | - | - | 1.9 | |||
300 |
A
|
4 | - | - | 44.5 | ||
296 | 4 | - | - | 3.0 | |||
282 | 4 | - | - | 72.7 | |||
306 | 4 | - | - | 65.8 | |||
285 | 4 | - | - | 9.5 | |||
308 | 4 | - | - | 70.0 | |||
301 | 4 | - | - | 5.3 | |||
307 | 4 | - | - | 46.2 | |||
299 |
Plant
|
4 | - | - | 12.8 | ||
284 | 4 | - | - | 0.0 | |||
289 | 4 | - | - | 9.0 | |||
290 | 4 | - | - | 0.7 | |||
309 | 4 | - | - | 70.0 | |||
302 |
A
|
4 | - | - | 19.4 | ||
298 | 4 | - | - | 74.8 | |||
287 | 4 | - | - | 12.9 | |||
303 | 4 | - | - | 10.3 | |||
286 | 4 | - | - | 5.8 | |||
292 | 4 | - | - | 5.7 | |||
291 | 4 | - | - | 7.5 | |||
277 | 4 | - | - | 25.7 | |||
304 | 4 | - | - | 87.8 | |||
350 | 3 | - | - | 51.6 | |||
311 | 3 | - | - | 2.1 | |||
326 | 3 | - | - | 0.4 | |||
319 | 3 | - | - | 4.0 | |||
344 | 3 | - | - | 0.0 | |||
336 | 3 | - | - | 9.8 | |||
351 | 3 | - | - | 37.5 | |||
329 | 3 | - | - | 9.4 | |||
346 | 3 | - | - | 9.4 | |||
334 | 3 | - | - | 10.4 | |||
345 | 3 | - | - | 11.5 | |||
318 |
DNA directed
|
3 | - | - | 2.4 | ||
337 | 3 | - | - | 9.0 | |||
320 | 3 | - | - | 13.5 | |||
338 |
DNA directed
|
3 | - | - | 5.3 | ||
328 | 3 | - | - | 12.2 | |||
352 | 3 | - | - | 65.4 | |||
343 |
A
|
3 | - | - | 11.8 | ||
321 | 3 | - | - | 35.3 | |||
340 | 3 | - | - | 1.3 | |||
349 | 3 | - | - | 6.9 | |||
323 | 3 | - | - | 56.9 | |||
330 | 3 | - | - | 2.1 | |||
353 | 3 | - | - | 38.4 | |||
315 | 3 | - | - | 33.4 | |||
317 | 3 | - | - | 1.2 | |||
342 | 3 | - | - | 53.5 | |||
341 | 3 | - | - | 4.7 | |||
322 | 3 | - | - | 17.8 | |||
354 | 3 | - | - | 81.4 | |||
316 | 3 | - | - | 58.3 | |||
314 | 3 | - | - | 31.4 | |||
339 | 3 | - | - | 14.0 | |||
325 | 3 | - | - | 0.0 | |||
333 | 3 | - | - | 0.0 | |||
347 | 3 | - | - | 8.3 | |||
313 | 3 | - | - | 25.6 | |||
331 | 3 | - | - | 16.8 | |||
348 | 3 | - | - | 0.0 | |||
324 | 3 | - | - | 0.0 | |||
312 | 3 | - | - | 9.6 | |||
332 | 3 | - | - | 5.0 | |||
327 | 3 | - | - | 0.5 | |||
458 | 2 | - | - | 0.0 | |||
486 | 2 | - | - | 39.9 | |||
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413 | 2 | - | - | 0.0 | |||
432 | 2 | - | - | 33.0 | |||
359 | 2 | - | - | 1.2 | |||
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461 | 2 | - | - | 6.9 | |||
425 | 2 | - | - | 0.0 | |||
395 | 2 | - | - | 2.1 | |||
412 | 2 | - | - | 0.7 | |||
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467 | 2 | - | - | 0.0 | |||
474 | 2 | - | - | 0.0 | |||
472 | 2 | - | - | 0.0 | |||
457 | 2 | - | - | 0.0 | |||
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406 | 2 | - | - | 0.0 | |||
365 | 2 | - | - | 10.0 | |||
408 | 2 | - | - | 3.8 | |||
431 | 2 | - | - | 12.1 | |||
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453 | 2 | - | - | 4.8 | |||
405 | 2 | - | - | 0.0 | |||
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427 | 2 | - | - | 20.0 | |||
426 | 2 | - | - | 0.0 | |||
483 | 2 | - | - | 34.0 | |||
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469 | 2 | - | - | 5.1 | |||
471 | 2 | - | - | 1.9 | |||
439 | 2 | - | - | 12.2 | |||
362 | 2 | - | - | 5.0 | |||
407 | 2 | - | - | 0.0 | |||
376 | 2 | - | - | 22.3 | |||
371 | 2 | - | - | 7.6 | |||
473 | 2 | - | - | 0.0 | |||
451 | 2 | - | - | 0.0 | |||
430 | 2 | - | - | 24.1 | |||
447 | 2 | - | - | 2.6 | |||
415 | 2 | - | - | 11.3 | |||
438 | 2 | - | - | 44.2 | |||
493 | 2 | - | - | 43.6 | |||
400 | 2 | - | - | 0.0 | |||
442 | 2 | - | - | 0.0 | |||
465 | 2 | - | - | 5.1 | |||
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484 | 2 | - | - | 35.4 | |||
397 | 2 | - | - | 0.0 | |||
401 | 2 | - | - | 0.0 | |||
470 | 2 | - | - | 0.0 | |||
437 | 2 | - | - | 38.4 | |||
364 | 2 | - | - | 4.4 | |||
460 | 2 | - | - | 0.0 | |||
452 | 2 | - | - | 0.0 | |||
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441 | 2 | - | - | 0.0 | |||
428 | 2 | - | - | 10.1 | |||
394 | 2 | - | - | 0.0 | |||
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409 | 2 | - | - | 0.0 | |||
489 | 2 | - | - | 43.9 | |||
478 | 2 | - | - | 9.3 | |||
384 | 2 | - | - | 40.5 | |||
420 | 2 | - | - | 0.0 | |||
466 | 2 | - | - | 0.0 | |||
463 | 2 | - | - | 6.3 | |||
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444 | 2 | - | - | 0.0 | |||
456 | 2 | - | - | 0.4 | |||
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477 | 2 | - | - | 0.0 | |||
360 | 2 | - | - | 39.1 | |||
375 | 2 | - | - | 10.1 | |||
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361 | 2 | - | - | 0.0 | |||
481 | 2 | - | - | 21.1 | |||
421 | 2 | - | - | 0.0 | |||
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443 | 2 | - | - | 0.0 | |||
367 | 2 | - | - | 14.5 | |||
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436 | 2 | - | - | 45.8 | |||
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372 | 2 | - | - | 20.6 | |||
476 | 2 | - | - | 0.0 | |||
355 | 2 | - | - | 0.0 | |||
423 | 2 | - | - | 0.0 | |||
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464 | 2 | - | - | 0.0 | |||
435 | 2 | - | - | 36.9 | |||
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396 | 2 | - | - | 0.0 | |||
482 | 2 | - | - | 31.2 | |||
450 | 2 | - | - | 0.0 | |||
356 | 2 | - | - | 0.0 | |||
454 | 2 | - | - | 0.0 | |||
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480 | 2 | - | - | 0.0 | |||
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357 | 2 | - | - | 0.0 | |||
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358 | 2 | - | - | 0.0 | |||
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370 | 2 | - | - | 18.0 | |||
380 | 2 | - | - | 33.1 | |||
445 | 2 | - | - | 0.6 | |||
369 | 2 | - | - | 17.8 | |||
368 | 2 | - | - | 10.0 | |||
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433 | 2 | - | - | 29.8 | |||
411 | 2 | - | - | 0.0 | |||
398 | 2 | - | - | 1.0 | |||
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728 | 1 | - | - | 0.0 | |||
495 | 1 | - | - | 0.0 | |||
686 | 1 | - | - | 0.0 | |||
690 | 1 | - | - | 0.0 | |||
558 | 1 | - | - | 0.0 | |||
573 | 1 | - | - | 0.0 | |||
638 | 1 | - | - | 0.0 | |||
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